Celem projektu Pedagogia Tolerancji. Podążając za Karolem Wojtyłą jest kształtowanie myślenia, postaw i zachowań dotyczących drugiego człowieka, opartych na poszanowaniu jego godności, bez wykluczania, kategoryzowania i wartościowania na lepszych i gorszych, swoich i obcych.

Zajmuje nas tolerancja jako postawa w duchu myślenia i pedagogii Karola Wojtyły. Poszukując odpowiedzi na pytanie: czym jest postawa tolerancji i jak ją praktykować na co dzień, chcemy, w imię społecznej odpowiedzialności nauki, czerpać z tego dziedzictwa, gdzie fides et ratio wzajemnie się dopełniają, a nie rywalizują ze sobą.